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产品选择指南

技术服务信息

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RNA建库试剂盒SMART-Seq® Total RNA Pico Input (ZapR™ Mammalian)
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634357 SMART-Seq® Total RNA Pico Input (ZapR™ Mammalian) 24 Rxns ￥17,781
￥11,558
Clontech 634358 SMART-Seq® Total RNA Pico Input (ZapR™ Mammalian) 96 Rxns ￥48,794
￥31,716
Clontech 634359 SMART-Seq® Total RNA Pico Input (ZapR™ Mammalian) 4 × 96 Rxns ￥175,660
Clontech 634756 Unique Dual Index Kit (1–24) 24 Rxns 询价
Clontech 634752 Unique Dual Index Kit (1–96) 96 Rxns 询价
询价
Clontech 634753 Unique Dual Index Kit (97–192) 96 Rxns 询价
询价
Clontech 634754 Unique Dual Index Kit (193–288) 96 Rxns 询价
询价
Clontech 634755 Unique Dual Index Kit (289–384) 96 Rxns 询价
询价

*红字为促销价格，促销时间: 2025年3月1日-2025年5月31日

低起始量链特异性RNA-Seq分析
SMART-Seq® Total RNA Pico Input (ZapR™ Mammalian)
· 高灵敏度：可以250 pg-10 ng的人、小鼠或大鼠总RNA起始
· 兼容性广：可以不同品质RNA(包括FFPE、LCM样品以及cfRNA等)制备文库，获得高再现性的数据
· 性能提升：无需大量添加 PhiX 的情况下也能实现较高比率的clusters passing filter（%PF），识别更多转录本，重复更少
· 链特异性：保留转录本链来源信息，识别准确度高
· 操作简便：整体流程只需6 h，改良buffer配方，缩短文库纯化时间
· Illumina文库：搭配Uinque Dual Index使用，最多可制备384种Illumina文库
 
注：SMART-Seq Total RNA Pico Input (ZapR Mammalian)是SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian的替代品，性能提升，如下所示：
 
i：提升ZapR技术去除rRNA cDNA 效率，以更好地剔除不需要的reads信息
ii：试剂盒中不包含index，但可以与Unique Dual Index (UDI) kits（24 Rxns，96 Rxns）灵活地搭配使用
 
■ 产品说明
SMART-Seq Total RNA Pico Input (ZapR Mammalian) 设计用于从皮克级总RNA(250 pg-10 ng)中高效制备测序文库。本试剂盒采用SMART技术(Switching Mechanism at the 5' end of RNA Template) ，适用于高品质、部分降解及低品质RNA（如来自于FFPE或LCM样品）。本试剂盒是一体化操作流程，保留了链来源信息，并且不需要下游文库制备，在反转录和PCR扩增过程中就可以添加indexes和接头。包括文库构建及纯化的全部操作流程只需6 h。
核糖体RNA在总RNA中占有很高的比重（约90%）。在制备文库前从总RNA中去除核糖体来源的RNA，有利于降低测序成本，提高统计数据的mapping率。但是在以微量样品起始时，去除rRNA的前处理操作，会造成纯化后的样品太少而不能制备高品质测序文库。本试剂盒采用特异针对哺乳动物rRNA和部分线粒体RNA的探针去除核糖体cDNA（来源于核糖体RNA的cDNA片段）。
采用本试剂盒所构建的文库，在无需大量添加 PhiX 的情况下也能实现较高比率的clusters passing filter（%PF），即使在基于双通道SBS技术的Illumina平台（如 NextSeq® 和 MiniSeq™）以及 HiSeq® 3000/4000上也是如此。每个run可以获得更多的生物学相关测序reads，反过来减少了测序成本。同时，可以获得更多的特异转录本，更低的rRNA、mtRNA比对率和重复率。
 
不同样品起始量解决方案
·10-100 ng总RNA，推荐使用SMART-Seq Total RNA Mid Input
·100 ng-1 μg总RNA，推荐使用SMART-Seq Total RNA High Input (RiboGone™ Mammalian)
 
■ 流程概要
 
■ 性能数据
实验方法
选择250 pg和10 ng的人脑RNA样本起始，使用SMART-Seq Total RNA Pico Input制备文库。之后分别采用ZapR Mammalian rRNA Depletion Kit试剂盒中的?？榇恚?）和未处理（-），并通过PCR扩增进行富集或者不进行处理。最后使用CogentAP 对2x106 PE reads进行数据分析。
 
☆ 不同起始量RNA样本起始，均可有效去除核糖体RNA来源cDNA
Panel A的柱状图和Panel B的表展示了用ZapR Mammalian rRNA Depletion Kit处理（+）和未处理（-）的文库的reads分布
 
☆ 不同起始量RNA样本起始，均可获得可靠的结果
Panel A的柱状图和Panel B的表格数据分别展示了用ZapR Mammalian rRNA Depletion Kit处理（+）和未处理（-）的文库基因检测数和转录本检测数
 
☆ 不同起始量均可获得高重复再现性结果
从上图可以看出，以250 pg和10 ng RNA起始制备的文库具有高度一致性。
 
 
产品详情请点击：
 
 

页面更新：2025-02-08 15:47:07