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RNAiso Plus |
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鸡软骨及骨组织中的RNA提取 |
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[使用试剂] |
RNAiso Plus(Code No. 9108) |
High-Salt Solution for Precipitation (Plant)(Code No. 9193) |
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[检测样品] |
鸡软骨组织 200 mg |
鸡骨组织 200 mg |
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[方法] |
1. RNA提取 |
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· |
将200mg鸡软骨组织和骨组织移至乳钵中,边加液氮边研磨至粉末。 |
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· |
液氮挥发后,加入4ml RNAiso Plus,再次进行匀浆后按照RNAiso Plus的操作流程进行了RNA提取。但是在异丙醇沉淀时,加入0.25倍RNAiso Plus体积量的High-Salt Solution for Precipitation (Plant)混合,再加入0.25倍RNAiso Plus体积量的异丙醇,混合后再按照RNAiso Plus的操作流程回收了total RNA。最后溶解于30 μl RNase-free water。 |
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· |
与没有添加High-Salt Solution for Precipitation (Plant)的相同检测样品按照RNAiso Plus的操作流程回收的total RNA进行了比较。 |
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2. RT-PCR |
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· |
使用1提取的RNA对β-actin进行了RT-PCR。使用扩增mRNA来源和基因组DNA来源DNA时扩增片段大小不同的引物,对混入的基因组DNA进行了确认。 |
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[结果] |
1. 提取RNA的电泳结果 |
<软骨组织> |
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Lane: |
提取方法 |
1、2: |
RNAiso Plus |
3、4: |
RNAiso Plus+High-Salt Solution
for Precipitation (Plant) |
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<骨组织> |
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Lane: |
提取方法 |
1、2: |
RNAiso Plus |
3、4: |
RNAiso Plus+High-Salt Solution
for Precipitation (Plant) |
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Total RNA 5 μl Apply |
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1% Agarose |
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M: DL2,000 DNA Marker |
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2. 提取RNA的收量和纯度 |
<软骨组织> |
检测样品No.
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提取方法 |
提取量
(μl) |
A260 |
A280 |
A260/A230 |
A260/A280 |
RNA量*1
(μg/100 mg组织)
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1 |
RNAiso Plus |
30 |
66.36 |
44.60 |
1.06 |
1.49 |
79.63*2 |
2 |
RNAiso Plus |
30 |
85.77 |
51.31 |
0.99 |
1.67 |
102.92*2 |
3 |
RNAiso Plus+High-Salt |
30 |
4.56 |
2.43 |
2.43 |
1.88 |
5.47 |
4 |
RNAiso Plus+High-Salt |
30 |
5.66 |
2.90 |
1.66 |
1.95 |
6.79 |
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<骨组织> |
检测样品
No. |
提取方法 |
提取量
(μl) |
A260 |
A280 |
A260/A230 |
A260/A280 |
RNA量*1
(μg/100 mg组织) |
1 |
RNAiso Plus |
30 |
83.00 |
49.15 |
0.99 |
1.67 |
99.61*2 |
2 |
RNAiso Plus |
30 |
80.46 |
57.75 |
0.91 |
1.39 |
96.55*2 |
3 |
RNAiso Plus+High-Salt |
30 |
4.56 |
2.55 |
1.75 |
1.97 |
6.01 |
4 |
RNAiso Plus+High-Salt |
30 |
5.66 |
3.28 |
2.08 |
1.98 |
7.79 |
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*1 RNA量:利用A260计算出的值 |
*2 仅使用RNAiso Plus提取的检测样品中因含有大量的多糖等杂质, 认为A260的测定值没有反映出准确的RNA量。 |
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3. 提取的RNA进行了RT-PCR反应 |
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RNA Sample: |
各500 ng |
RT Primer: |
Oligo dT Primer |
反转录酶: |
Reverse Transcriptase M-MLV (RNase H-)(Code No. 2641) |
PCR酶: |
TaKaRa LA Taq(Code No.RR002A) |
反转录反应: |
10 μl |
PCR反应体系: |
50 μl(使用2 μl反转录反应液) |
Target: |
β-actin |
mRNA来源的扩增片段大小: |
561bp |
genome DNA来源的扩增片段大?。?/span> |
561bp |
PCR 条件: |
98℃ 30 sec. |
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30 cycles |
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55℃ 10 sec. |
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72℃ 1 min. |
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<骨组织> |
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Lane: |
提取方法 |
1: |
RNAiso Plus |
2: |
RNAiso Plus [RTase(-)] |
3: |
RNAiso Plus+High-Salt |
4: |
RNAiso Plus+High-Salt [RTase(-)] |
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PCR反应液 10μl上样 |
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3% Agarose |
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M:100 bp DNA Ladder |
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[总结] |
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使用RNAiso Plus从骨和软骨中提取RNA过程中,在异丙醇沉淀沈时加入High-Salt Solution for Precipitation (Plant)后回收RNA、可制备A260/A280比值高于1.8的高纯度total RNA。软骨来源RNA进行凝胶电泳时还可确认到核糖体RNA片段。 |
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· |
从RT-PCR的结果可以看出,从软骨中提取RNA时,仅使用RNAiso Plus 提取的RNA有微弱的扩增产物,而使用High-Salt Solution for Precipitation (Plant)提取的RNA,软骨来源和骨来源均可获得清晰的扩增产物。此外,二者在RTase(-)的扩增结果中没有确认到基因组来源的扩增产物。 |
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· |
一般从骨和软骨组织中很难提取RNA,但使用RNAiso Plus提取RNA时与High-Salt Solution for Precipitation (Plant)并用可获得如本实验所示的高纯度RNA。 |
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