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使用各公司PCR酶扩增亚硫酸氢盐处理后的DNA |
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【方法】 |
以亚硫酸氢盐处理后的HeLa基因组DNA为模板,使用TaKaRa EpiTaq HS及其他公司的PCR酶进行扩增。
(处理后的HeLa基因组DNA 100 ng/50 μl反应体系) 反应按以下条件进行。 |
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亚硫酸氢盐处理:MethylEasy Xceed Rapid DNA Bisulphite Modification Kit(Code No. ME002) |
目的基因:CDKN2A、BRCA1 gene 上游的CpG 岛区域 |
扩增大?。?44 bp (CDKN2A)、1,017 bp (BRCA1) |
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<反应液组成> |
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使用量 |
终浓度 |
亚硫酸氢盐处理HeLa 基因组DNA(50 ng/μl) |
2 μl |
100 ng/50 μl |
10 × EpiTaq PCR Buffer (Mg2+ free) |
5 μl |
1× |
25 mM MgCl2 |
5 μl |
2.5 mM |
dNTP Mixture(各2.5 mM) |
6 μl |
0.3 mM |
Sense Primer(20 μM) |
1 μl |
0.4 μM |
Antisense Primer(20 μM) |
1 μl |
0.4 μM |
TaKaRa EpiTaq HS(5 U/μl) |
0.25 μl |
1.25 U/50 μl |
灭菌水 |
up to 50 μl |
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<PCR条件> |
98℃ 10 sec. |
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40 cycles |
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55℃ 30 sec. |
72℃?。?0 sec.(144 bp)or 1 min.(1,017 bp)] |
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(TaKaRa EpiTaq HS以外的其他试剂按各公司反应条件进行反应) |
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【结果】 |
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